Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnn1bQ9WU38 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms