Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plod1Q9R0E2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms