Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Wdr54Q9R0D8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms