Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lamc3Q9R0B6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms