Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nubp1Q9R060 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nubp1Q9R060 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nubp1Q9R060 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nubp1Q9R060 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nubp1Q9R060 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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