Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sh2d3cQ9QZS8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms