Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col4a3Q9QZS0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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