Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clcf1Q9QZM3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clcf1Q9QZM3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms