Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChmlQ9QZD5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChmlQ9QZD5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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