Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenphQ9QYM8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms