Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms