Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cpsf3Q9QXK7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms