Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Limd1Q9QXD8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Limd1Q9QXD8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms