Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim44Q9QXA7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms