Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Homer2Q9QWW1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms