Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CubnQ9JLB4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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