Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gde1Q9JL56 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gde1Q9JL56 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gde1Q9JL56 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms