Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hmgn5Q9JL35 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hmgn5Q9JL35 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hmgn5Q9JL35 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hmgn5Q9JL35 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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