Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms