Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb3Q9JKS4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms