Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irx5Q9JKQ4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Irx5Q9JKQ4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Irx5Q9JKQ4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Irx5Q9JKQ4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Irx5Q9JKQ4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irx5Q9JKQ4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms