Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrac1Q9JKP8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms