Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms