Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rb1cc1Q9ESK9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms