Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtofQ9ESF1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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