Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim54Q9ERP3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim54Q9ERP3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms