Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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