Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfip11Q9ERA6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfip11Q9ERA6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms