Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cxcr6Q9EQ16 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cxcr6Q9EQ16 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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