Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms