Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trmt112Q9DCG9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trmt112Q9DCG9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms