Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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