Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms