Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms