Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Swt1Q9DBQ9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Swt1Q9DBQ9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms