Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp2aQ9DB34 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp2aQ9DB34 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms