Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms