Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim23Q9DAL0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms