Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ift43Q9DA69 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms