Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp12Q9D9M2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp12Q9D9M2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp12Q9D9M2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp12Q9D9M2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp12Q9D9M2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp12Q9D9M2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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