Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifi35Q9D8C4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms