Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tspan13Q9D8C2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms