Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fip1l1Q9D824 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms