Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capns2Q9D7J7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capns2Q9D7J7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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