Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms