Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Borcs6Q9D6W8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Borcs6Q9D6W8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Borcs6Q9D6W8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Borcs6Q9D6W8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Borcs6Q9D6W8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms