Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdr42e1Q9D665 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms