Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm3404Q9D506 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm3404Q9D506 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm3404Q9D506 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3404Q9D506 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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