Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms