Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efhd1Q9D4J1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms